中瑞政府间科技合作始于1978年两国政府签署的“中瑞工业和科学技术协定”，当时双方执行单位是中国国家经委和瑞典工业部。在此协议框架下，1981年原国家科委与瑞典工业技术发展局签署合作协议，拓宽了双方的合作领域和交流渠道并延续了科技合作联委会机制。2001年后，新成立的瑞典创新局代替工业技术发展局继续执行双方的合作协议，至2003年12月双方共举办过第十五次科技合作联委会。

　　为进一步加强中瑞科技合作关系，两国科技主管部门中国科技部与瑞典教科部（Ministry of Education and Research）于2004年12月在瑞典首都斯德哥尔摩签订了新的“中瑞科技合作协定”。这个协定为两国在科学研究和产业技术创新方面的交流与合作搭建了良好的平台。此后，瑞典教科部于2007年成立“与中国合作协调组”，由该部牵头，创新局、能源署、科学基金会、各大学等多个部门代表参加，为推动双边科技合作加强了协调组织机制。

　　2007年9月，中瑞双方在北京举办了“中瑞科技周”活动暨首届中瑞科技合作联委会。瑞典教科大臣拉什·雷荣堡（Lars Leijonborg）在来自教科部、贸工部、卫生部、环保部的4位国务秘书陪同下，率政府部门、研究机构和企业的100余名代表参加了上述活动。

　　瑞典教科大臣访华期间，中国科技部万钢部长和尚勇副部长分别会见了拉什大臣和代表团部分成员。在双方续签“中瑞科技合作协议”后举行的首届科技合作联委会上，双方就进一步加强在通讯、材料、新能源、生物医药等领域的合作交换了意见。中瑞科技周活动期间，双方还组织了科技创新政策、材料科学、下一代通信和网络、能源环境与气候、公共卫生及中医药等6个重点领域的研讨会，并在通讯、生物医药领域签订多个合作意向书，有效地促进了双方在上述领域的交流与合作。

　　在新的科技合作协定框架下，双方在通讯、材料、新能源、生物医学等重点领域的合作取得了新进展。

　　新材料领域，双方以由北京钢铁研究院和瑞典査尔摩斯大学合作建立的“中瑞新材料技术交流中心”为平台，保持了有企业参与的学术交流活动。

　　通讯技术领域，2008年双方在开展“下一代通信和网络”合作计划下，联合资助由双方大学和研究机构提出的7个项目，瑞方投入2700万克朗，中方投入2200万元。

　　能源领域，2008年双方确立将“生物能源”（Bio-energy）作为未来交流合作的重点。中国工程院和瑞典皇家工程院在这个主题下连续5年保持了学术互访交流。瑞典普拉克环保系统（北京）有限公司与海南市有关部门等合作，推动沼气生产技术和沼气在公交车燃料方面的应用。

　　生物医学领域，2007年以来天津市与卡洛琳斯卡医学院发展了交流与合作关系。2008年双方就在天津合作建立“分子生物医学中心天津分中心”（CMM-TJ）达成初步意向。目前双方主管部门在考虑加强生物医学领域的学术交流和合作研究。

　　除上述合作外，双方在环保、空间技术等领域的合作也有显著进展。环保领域，在2007年6月胡锦涛主席访瑞期间，双方签署了为期5年的两国环境合作谅解备忘录，重点在水管理、空气污染控制、化学品管理、生物多样性、废弃物管理、环境管理、环境产业和技术等方面加强合作。

　　空间技术领域，2005年以来瑞典空间公司与中国航天科技集团公司等部门开展了多次研讨交流，2008年中国卫星测控中心与瑞典空间公司签订长期合作协议，拟在瑞典北部建立卫星地面接收站，提供卫星数据传输服务。

　　此外，中瑞双方多个政府机构和学术组织保持了工作往来和学术交流关系。如中国科技部与瑞典创新局、能源署；中国环保部与瑞典环保署；中国工程院与瑞典皇家工程院；中国科学院与瑞典皇家科学院等。